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Biología
La Pérdida de Genes Contribuyó a la Evolución
Humana
30
de Enero de 2008.
La
evolución de nuevos genes no es la única forma que tiene una especie
para cambiar. La pérdida de genes puede también llevar a adaptaciones
que ayuden a la especie a sobrevivir, pero esta idea no ha sido bien
estudiada. Ahora, científicos de la Universidad de California en Santa
Cruz han llevado a cabo el primer análisis computacional sistemático
para identificar genes que se perdieron durante los millones de años de
evolución que condujeron a la especie humana.
Menéame
El trabajo ha sido realizado por Jingchun Zhu (especialista en
bioinformática) con la colaboración de David Haussler (profesor de
ingeniería biomolecular), Zack Sanborn y otros investigadores de la
universidad. Es el primer estudio diseñado para buscar en todo el genoma
la pérdida relativamente reciente de genes que no tienen copias exactas
ni aproximadas en otra parte del genoma. Es probable que éstas sean las
pérdidas más importantes de genes.
La idea de que las pérdidas de genes podrían contribuir a la adaptación
ha sido manejada anteriormente, pero no se la ha investigado como
debiera.
Para encontrar las pérdidas de genes, los investigadores emplearon un
software denominado TransMap. El programa comparó los genomas de ratón y
de humano buscando genes que presentan cambios lo bastante
significativos para hacerlos no funcionales en algún punto del periodo
de 75 millones de años transcurrido desde la divergencia de los linajes
de ambos organismos.
Como el perro divergió de nuestro ancestro común antes que el ratón, los
investigadores emplearon el genoma del perro como referencia "externa"
para filtrar los falsos positivos. Si un gen todavía existe en el perro
y en el ratón, pero no en los humanos, probablemente existió en el
antepasado común y se perdió entonces en el linaje humano.
Utilizando este proceso, identificaron 26 pérdidas de antiguos genes,
incluyendo 16 que no se conocían previamente.
Luego compararon los genes identificados en el genoma completo del ser
humano, el chimpancé, el mono rhesus, el ratón, la rata, el perro y la
zarigüeya, para estimar la cronología evolutiva relativa a cuando el gen
era funcional, antes de que se perdiera. Este análisis refinó la
cronología de la pérdida de los genes y también sirvió como referencia
para saber si el gen estaba bien establecido desde bastante tiempo atrás
siendo por consiguiente funcional, o si sólo se trataba de la copia de
un gen redundante. A través de este proceso, encontraron seis genes que
sólo se habían perdido en el ser humano.
Después de varios análisis, los investigadores concluyeron que la
pérdida probablemente se produjo en el linaje de los primates, después
de la diferenciación del gorila y antes de la del chimpancé.
Los investigadores también identificaron otros genes perdidos en los
humanos y que no tenían ningún "homólogo funcional", o sea genes
alternativos que pudieran realizar la misma función en el genoma humano.
Algunos de estos genes perdidos habían sido funcionales durante más de
300 millones de años.
Información adicional en:
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