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Comparaciones Genómicas Más Sencillas
21 de Febrero de 2002.
 El National Energy Research Scientific Computing Center, del Berkeley Lab, ha desarrollado un programa especializado que es capaz de comparar rápidamente secuencias o genomas completos de especies distintas, localizando diferencias y similitudes muy útiles para los científicos que realizan estudios genéticos.
El programa se llama VISTA (Visualization Tools for Alignments) y ha sido muy bienvenido en una época que ya ha sido bautizada como la Era Genómica.
Hace un año, el Proyecto Genoma Humano alcanzó su objetivo de secuenciar nuestro genoma completo. Sin embargo, aunque los especialistas creían que disponer de esta secuenciación aportaría rápidas soluciones a todas las preguntas, esto no va a ser así, al menos de momento. En efecto, disponer del genoma no lo es todo. En cambio, poder comparar genomas de diferentes organismos sí resulta muy importante.
Lo más interesante en estos momentos no es contar genes sino averiguar qué hacen y cómo actúan. Descubrir los mecanismos reguladores, es el objetivo esencial. Pero dado que a menudo las secuencias reguladoras tienen apenas una longitud de unos pocos pares de bases, la tarea se hace complicada y a veces confusa.
La comparación de genomas es crucial para el proceso de investigación. Como explica Inna Dubchak, responsable del programa VISTA, si una secuencia de ADN es muy similar tanto en un ratón como en un ser humano, es probable que dicha secuencia haya persistido desde que la desarrollara el ancestro común de ambas especies, hace entre 80 y 100 millones de años. Bajo esta premisa, no será tan sorprendente encontrarla también en monos, cerdos o conejos, e incluso quizá tenga similitudes con otras procedentes de especies distantes como pollos o peces.
El programa VISTA puede comparar las secuencias de dos organismos o de varios, buscando similitudes, o comparar el ADN de especies muy relacionadas, en busca de sus diferencias. Cuando comparamos especies muy próximas, como hombres y chimpancés, el interés principal radica en las diferencias porque así se encuentran pistas sobre sus orígenes evolutivos.
El paquete de software está disponible en la página web del proyecto y los biólogos interesados pueden usarlo si lo desean.
Información adicional en:
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