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Biología
Convertir Secuencias de Proteínas
en Música
14 de
Junio de 2007.
Unos
biólogos moleculares de la Universidad de California en Los Ángeles
(UCLA) han convertido secuencias de proteínas en composiciones
originales de música clásica.
"Convertimos la secuencia de proteínas en música y podemos obtener una
señal auditiva para cada proteína", explica Jeffrey H. Miller, profesor
de microbiología, inmunobiología y genética molecular, así como miembro
del Instituto de Biología Molecular de la UCLA. "Cada proteína tendrá
siempre su estructura sonora exclusiva porque cada proteína tiene una
secuencia exclusiva. Por eso, es posible escuchar la secuencia de cada
proteína".
"Asignamos un acorde a cada aminoácido", explica Rie Takahashi,
investigadora de la UCLA que además es pianista de música clásica y que
cuenta en su haber con un galardón por tal actividad artística. Lo que
ella y sus colegas pretenden es comprobar si resulta viable escuchar la
secuencia de un aminoácido o proteína y captar pautas en la música, un
enfoque radicalmente diferente al de mirar las letras de la secuencia.
Los bloques que forman las proteínas son secuencias lineales de 20
aminoácidos distintos. La asignación de una nota para cada aminoácido,
traería como resultado una escala de 20 notas.
"Una escala de 20 notas es demasiado amplia", explica Takahashi. Se
necesita una escala reducida, de modo que emparejamos los aminoácidos
similares y usamos acordes y las variaciones de los mismos para cada
aminoácido. Utilizamos cada componente musical para indicar una
característica específica de la proteína. Hemos logrado una conversión
fiel de la secuencia a la música. El ritmo es dictado por la secuencia
de la proteína".
En la web de los biólogos, se pueden escuchar las composiciones e,
incluso, presentar nuestras propias secuencias genéticas y obtenerlas
traducidas a música. El navegador permite a cualquiera enviar el código
secuenciado para una proteína, que será convertida en música y devuelta
como un fichero de audio MIDI.
Takahashi y Miller no son los primeros científicos que intentan
convertir secuencias de proteínas en música, pero según ellos, su música
es más melódica y menos "agitada" que la obtenida en intentos previos.
Inicialmente, Takahashi convirtió los aminoácidos y tocó el resultado al
piano. En estos momentos, experimentan con un programa informático
escrito por su colega Frank Pettit, que utiliza sus reglas para
convertir las secuencias de las proteínas en música. De este modo,
esperan acelerar la traducción de grandes segmentos de genomas.
Información adicional en:
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