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Biología
Una Especie, Muchos Genomas
4 de
Septiembre de 2007.
 Crecimiento
más rápido, hojas más oscuras, una manera distinta de ramificarse...
Variedades silvestres de la planta Arabidopsis thaliana son a menudo
sustancialmente diferentes del linaje de laboratorio de esta pequeña
planta de la mostaza, una favorita de muchos biólogos para las
investigaciones con vegetales. Por vez primera, se ha investigado qué
diferencias detalladas hay entre los genomas de las estirpes del círculo
polar o la franja subtropical, de América, África, o Asia.
La labor la han llevado a cabo equipos de investigación de Tübingen
(Alemania), y California, dirigidos por Detlef Weigel, del Instituto Max
Planck para la Biología del Desarrollo. Los resultados son
sorprendentes: la magnitud de las diferencias genéticas excede con mucho
las expectativas para un genoma tan compacto.
Para rastrear la variación en el genoma de los diferentes linajes de
Arabidopsis, los investigadores compararon el material genético de 19
estirpes silvestres con el genoma de la de laboratorio, que fue
secuenciada en el año 2000. Usando un procedimiento muy elaborado,
examinaron cada uno de los aproximadamente 120 millones de "bloques de
construcción" del genoma. Para su espionaje molecular, usaron una
cantidad enorme de sondas de ADN especialmente diseñadas; tantas, que,
colocadas todas juntas, el conjunto de estas sondas tendría unas siete
veces la longitud del genoma humano.
Los datos fueron evaluados con varios métodos estadísticos creados al
efecto.
El resultado de este análisis esmerado: Como promedio, cada 180 bloques
de construcción de ADN, hay uno que resulta variable. Y alrededor del
cuatro por ciento del genoma de referencia parece muy diferente en las
variedades silvestres, o simplemente no aparece. Casi cada diez genes,
hay uno que resulta tan defectuoso que ya no puede cumplir su función
normal.
Resultados como estos promueven preguntas fundamentales, y limitan el
valor de los genomas modelo secuenciados hasta ahora. "No existe lo que
pueda llamarse El Genoma De Una Especie", argumenta Weigel. "La
constatación de que la secuencia de ADN de un solo individuo no es
suficiente para valorar el potencial genético de una especie, tiene
también implicaciones para las investigaciones de la genética humana".
Es sorprendente que la Arabidopsis tenga un genoma tan plástico. En
contraste con el genoma del Ser Humano o el de muchas plantas de cultivo
como el maíz, el de la Arabidopsis es muy compacto; su tamaño es
inferior a la vigésima parte del que tienen el genoma humano o el genoma
del maíz, a pesar de tener un número similar de genes. A diferencia de
estos otros genomas, hay en él pocas repeticiones o secuencias de
relleno aparentemente irrelevantes.
La variabilidad genética parece reflejar la adaptación ante
circunstancias locales. Es probable que tales genes variables permitan a
las plantas resistir condiciones secas o húmedas, calientes o frías, o
hacer uso de períodos de crecimiento cortos o largos.
Información adicional en:
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