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Bioquímico
Desvelando los Secretos del Origen de la Vida
Mediante Supercomputador
3 de Noviembre
de 2010.
Las
simulaciones mediante supercomputadora realizadas en el Laboratorio
Nacional estadounidense de Oak Ridge están ayudando a los científicos a
desvelar cómo los ácidos nucleicos pudieron contribuir a los orígenes de
la vida.
Un equipo de investigación dirigido por Jeremy Smith, quien dirige el
Centro para la Biofísica Molecular del mencionado laboratorio, usó
simulaciones de dinámica molecular para examinar una reacción de la
química orgánica que pudo ser importante en la evolución de los ácidos
ribonucleicos, o ARN, hacia las primeras formas de vida.
Ciertas clases de ARN llamadas ribozimas son capaces de almacenar
información genética y además catalizar reacciones químicas, dos
habilidades necesarias para la creación de vida. El equipo de
investigación analizó una ribozima desarrollada en laboratorio que
cataliza la reacción de Diels-Alder, la cual tiene amplias aplicaciones
en la química orgánica.
El fenómeno de la vida exige crear moléculas que se reproduzcan a sí
mismas, y esto requiere de moléculas que sean lo bastante complejas como
para lograrlo. Si una ribozima como la que cataliza la reacción de
Diels-Alder es capaz de efectuar el trabajo de química orgánica
necesario para construir moléculas complejas, entonces existe la
posibilidad de que un compuesto como ese estuviera presente en el
amanecer de la vida para crear los componentes básicos de ésta.
El equipo de investigación halló una explicación teórica para el hecho
de que la ribozima catalizadora de la reacción de Diels-Alder necesite
magnesio para funcionar. Los modelos computacionales de los movimientos
internos de la ribozima posibilitaron a los investigadores captar y
comprender detalles precisos de la muy rápida reacción. La naturaleza
estática de las técnicas experimentales convencionales no había podido
revelar la dinámica del sistema.
Los cálculos realizados por los autores del estudio muestran que la
dinámica interna de la ribozima incluye un punto activo, o "boca", que
se abre y cierra para controlar la reacción. La concentración de iones
de magnesio influye de forma directa en los movimientos de la ribozima.
Cuando no hay magnesio presente, la boca se cierra, el substrato no
puede entrar, y no puede producirse la reacción. El equipo de
investigación ha descubierto que los iones de magnesio se adhieren a un
punto especial sobre la ribozima para mantener abierta la boca.
Información adicional en:
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La traducción, la
adaptación y la elaboración de texto adicional de este artículo han sido
realizadas por el equipo de NC&T (Amazings.com)
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